«ПРИМЕНЕНИЕ NGS ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ УСТОЙЧИВЫХ ФОРМ ТУБЕРКУЛЕЗА В УЗБЕКИСТАНЕ»

Аннотация

Целью настоящей работы стало изучение молекулярных механизмов лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis к бедаквилину и деламаниду с применением полногеномного секвенирования. В исследование включены 350 штаммов, выделенных от пациентов с мультирезистентным туберкулезом. Генетический анализ позволил выявить ключевые мутации в генах Rv0678, atpE, ddn и fbiC. Проведен филогенетический анализ с определением генотипов. Установлены географические особенности распределения мутаций. Полученные данные позволяют точнее определять устойчивые формы туберкулеза и оптимизировать терапевтическую тактику. Результаты исследования подчеркивают значимость применения NGS как инструмента быстрой молекулярной диагностики при XDR-ТБ. Ключевые слова: Mycobacterium tuberculosis, бедаквилин, деламанид, полногеномное секвенирование, Rv0678, ddn, лекарственная устойчивость, туберкулез. Актуальность Устойчивость M. tuberculosis к новейшим противотуберкулезным средствам — бедаквилину и деламаниду — представляет собой серьезный вызов современной фтизиатрии. Несмотря на высокую эффективность этих препаратов, во многих странах, включая Узбекистан, фиксируются случаи их неэффективности из-за появления устойчивых штаммов. Традиционные методы фенотипического тестирования требуют значительного времени, тогда как молекулярные технологии, в частности полногеномное секвенирование (WGS), позволяют в кратчайшие сроки установить наличие мутаций, ассоциированных с лекарственной устойчивостью. В условиях высокой эпидемической напряженности ранняя диагностика таких форм инфекции становится критически важной. Это позволяет своевременно скорректировать лечебные схемы, снизить риск трансмиссии и улучшить прогноз. Данное исследование направлено на системное изучение мутационного спектра, характерного для штаммов, устойчивых к новым препаратам, с целью интеграции WGS в клиническую практику диагностики и эпидемиологического надзора в Узбекистане. Цель: Оценить мутационные особенности штаммов M. tuberculosis, резистентных к бедаквилину и деламаниду, с использованием полногеномного секвенирования, и выявить связи между генетическим профилем и географическим распространением резистентных форм. Материалы и методы 127 ` В исследование вошли 350 клинических изолятов M. tuberculosis, собранных от пациентов с подтвержденным мультирезистентным туберкулезом в 10 регионах Узбекистана. Диагностика устойчивости к бедаквилину и деламаниду проведена методом BACTEC MGIT 960. Геномное секвенирование выполнено с использованием платформы Oxford Nanopore MinION. Анализ мутаций проводился в генах Rv0678, atpE, ddn, fbiA, fbiC. Для интерпретации данных использовались базы данных TB-Profiler и WHO-MDR catalog. Географическая сопоставимость оценивалась по месту выявления. Статистика обрабатывалась в R v.4.3.1, применялся логистический регрессионный анализ и кластеризация SNP-древ по методу максимального правдоподобия.