Использование расширенных валентных последовательностей (молекулярных подписей) в QSAR и QSPR исследованиях

Аннотация

Молекулярный дескриптор позволяет кодировать химическое соединение так, чтобы задачи моделирования отношения «структура-активность» QSAR и «структура-свойство» QSPR были решены эффективно. Дескриптор молекулярной подписи является одним из немногих молекулярных дескрипторов, для которых была эффективно решена детерминированная обратная задача. Одним из этапов реализации последней является решение прямой задачи QSPR. В данной работе исследуется точность моделей SVM, построенных на дескрипторе подписи, в решении задачи QSAR. Для этого было проведено 5 вычислительных экспериментов с различными условиями в постановках задач: тип химического пространства, релевантность подписей, масштабирование выборки, взаимосвязь качества классификации на SVM с разными ядрами и коэффициентом моделеспособности выборки.