ЧАСТОТА МУТАЦИЙ ПОЛИМОРФИЗМА IVS2+1G>A и 1100delC ГЕНА CHEK2 в УЗБЕКСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

Аннотация

CHEK2 is one of the genes involved in DNA repair and plays a crucial role in the cell cycle, known as a tumor suppressor gene in breast cancer (BC). Our studies aimed to investigate the association of CHEK2 gene polymorphisms (IVS2+1G>A and 1100delC) with BC. DNA samples for the study were extracted from peripheral blood of 300 Uzbek women, 200 of whom formed the main group diagnosed with BC, and 100 women constituted the control group. Blood samples were collected and stored in EDTA tubes. PCR amplification was performed using the Corbett Research GRADIENT PALM CYCLER PCR Analyzers CG1-96 (Australia). Among the 200 BC patients, 4 were found to have the heterozygous genotype 1100delC (C/G), and 6 patients had the heterozygous genotype IVS2+1G>A (G/A). Annotatsiya. CHEK2 DNK reparatsiyasi, hujayra sikli jarayonlarida muhim rol o‘ynovchi genlardan biri bo‘lib, ko‘krak bezi saratoni (KBS)da o‘simtani bostiruvchi gen (gen-supressor) sifatida tanilgan. Bizning tadqiqotimiz CHEK2 genining polimorfizmlari (IVS2+1G>A va 1100delC)ning KBS bilan bog‘liqligini o‘rganishga qaratilgan. Tadqiqot uchun DNK namunalari o‘zbek millatiga mansub 300 nafar ayoldan olingan bo‘lib, ulardan 200 nafari KBS tashxisi qo‘yilgan, asosiy guruhni, 100 nafari nazorat guruhini tashkil etgan sog‘lom ayollar tashkil etdi. Qon namunalarini yig‘ish va saqlash EDTAli probirkalarda amalga oshirilgan. PZR-amplifikatsiya Corbett Research GRADIENT PALM CYCLER PZR Analyzers CG1-96 (Avstraliya) yordamida bajarilgan. KBS tashxisi qo‘yilgan 200 nafar bemordan 4 tasida 1100delC genotipining geterozigot shakli (C/G), 6 tasida esa IVS2+1G>A genotipining geterozigot shakli (G/A) aniqlangan. adu.uz universaljurnal.uz 790 “ZAMONAVIY BIOLOGIYANING DOLZARB MUAMMOLARI VA RIVOJLANISH ISTIQBOLLARI” xalqaro ilmiy-amaliy anjuman materiallari Ключевые слова. CHEK2, IVS2+1G>A, 1100delC, рак молочной железы, онкология, узбекская популяция, апоптоз. Keywords. CHEK2, IVS2+1G>A, 1100delC, breast cancer, oncology, Uzbek population, apoptosis. Kalit so’zlar. CHEK2, IVS2+1G>A, 1100delC, ko’krak bezi saratoni, O’zbek populyatsiasi, apoptoz. Введение. Рак молочной железы является наиболее распространённым видом рака среди женщин и основной причиной их смертности. В Узбекистане за период с 2019 по 2021 годы было диагностировано 10 984 случая рака молочной железы у женщин (You и др., 2021, с. 100255). В настоящее время существует множество данных о факторах, влияющих на возникновение рака. К этим факторам можно отнести и наследственную предрасположенность. Последние исследования подтверждают, что в возникновении рака молочной железы участвуют не только гены с высокой (BRCA1, BRCA2, TP53), но и с средней (ATM, CDH1 и CHEK2) и низкой пенетрантностью (Hu и др., 2021, с. 440-451). Частота встречаемости генов риска рака молочной железы различается в разных популяциях. Нам известно, что в Узбекистане частота распространения гена CHEK2 (белок CHK2) среди популяции узбекских женщин до сих пор не изучалась. Учитывая это нами была поставлина цель исследования и изучения связи двух полиморфизмов гена CHEK2 (1100delC, IVS2+1C>A) с раком молочной железы. Методы и материалы. ДНК была выделена из периферической крови исследуемых групп с использованием лизирующего раствора, фенола, хлороформа, этанола, наборов «AmpliPraym Ribo-prep» (ООО «Некст Био», Россия) и «Diatom TM DNA Prep 100» (Лаборатория Изоген, Россия). Количество и качество выделенной ДНК проверяли с помощью спектрофотометра NanoDrop 2000 (Thermo Fisher Scientific, США). Все молекулярно- генетические исследования были проведены в отделе молекулярной медицины и клеточных технологий Республиканского специализированного научно-практического медицинского центра гематологии. Анализ мутаций. Полиморфизмы 1100delC (rs555607708) и IVS2+1G>A (rs121908698) гена CHEK2 были исследованы методом электрофарезного ПЦР в соответствии с инструкциями к генетическим тест-наборам компании Litex (01338-100, ООО НПФ «Litex», Россия). Амплификация исследуемых локусов полиморфизмов 1100delC и IVS2+1G>A гена CHEK2 осуществлялась методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием амплификатора Corbett Research GRADIENT PALM CYCLER PCR Analyzers CG1-96 (Австралия). В ходе процесса использовались реагенты из тест-наборов компании Litex (01338-100, ООО НПФ «Litex», Россия). Детекция продуктов амплификации. Разделение продуктов амплификации проводилось методом горизонтального электрофореза в 3%-м агарозном геле, приготовленном на TAE-буфере. Для визуализации результатов электрофореза в гель добавляли 1% раствор бромида этидия (в количестве 5 мкл на 50 мл расплавленного геля). Анализируемые фрагменты ДНК наблюдались в виде ярких оранжево-красных полос под воздействиемУФ-излучения при длине волны 310 нм. Статистический анализ. Статистический анализ полученных результатов проводился с использованием статистических компьютерных программ«WinPEPI 2016, Version 11.65»и «EpiCalc 2000, Version 1.02». Выводы. Возраст пациенток основной группы варьировал от 29 до 8